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mRNA測序
產(chǎn)品簡介
轉(zhuǎn)錄組測序是通過高通量測序技術(shù)全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息，包括編碼RNA和非編碼RNA，結(jié)合生物信息技術(shù)獲得RNA的表達和調(diào)控信息，檢測多種RNA的表達和變化，同時建立不同類型的非編碼RNA與mRNA之間的調(diào)控關(guān)系，探索RNA之間的相互作用，構(gòu)建潛在的RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，系統(tǒng)的揭示生物現(xiàn)象背后RNA世界的轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律。
技術(shù)路線圖
結(jié)果展示
基因表達量小提琴圖（左）； 樣本相關(guān)性圖（中）； 差異表達基因火山圖（右）
差異基因在染色體上的分布圖（左）； 差異表達模式聚類圖（中）； circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)圖（右）
送樣要求
應(yīng)用方向
應(yīng)用案例
全轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白組共同揭示心力衰竭關(guān)鍵表達分子和蛋白靶點
Fibroblast-specific proteotranscriptomes reveal distinct fibrotic signatures of human sinoatrial node in nonfailing and failing hearts
發(fā)表雜志：Circulation（IF: 29.690）； 發(fā)表時間： 2021年 7月； 應(yīng)用技術(shù)： 全轉(zhuǎn)錄組測序
本研究采用從右心房和竇房結(jié)分離的成纖維細胞，經(jīng)體外培養(yǎng)后進行全轉(zhuǎn)錄組測序和定量蛋白組，繪制包括信使RNA、非編碼RNA（lncRNA和miRNA）和蛋白質(zhì)在內(nèi)的全面轉(zhuǎn)錄-蛋白組表達圖譜。全轉(zhuǎn)錄組測序分析，發(fā)現(xiàn)正常心臟和衰竭心臟中竇房結(jié)組織成纖維細胞的mRNA整體表達模式相似，表明二者有共同的信號通路和分子機制。正常心臟竇房結(jié)和右心房分離培養(yǎng)的成纖維細胞具有樣本特異性的差異。另外，本研究還是首次記錄人類竇房結(jié)組織成纖維細胞所特有的長鏈非編碼lncRNA。在加入TGF-β的組別比較中，miRNA在正常心臟和衰竭心臟中竇房結(jié)組織中呈現(xiàn)出明顯差別的表達模式。這項研究通過分子和蛋白質(zhì)靶點綜合圖譜，建立人心臟竇房結(jié)成纖維細胞蛋白-全轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。這些數(shù)據(jù)可用于識別分子和蛋白質(zhì)的特征、信號通路，以及心衰患者竇房結(jié)纖維化和心律失常的潛在治療靶點。
竇房結(jié)成纖維細胞全轉(zhuǎn)錄組表達譜組成（左）； 促纖維化相關(guān)的差異表達的mRNA基因（右）
lncRNA差異表達層次聚類熱圖分析（左）； miRNA表達差異表達層次聚類熱圖（右）
