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Mission Bio單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序（SNV+CNV+蛋白）
背景介紹
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究，幫助科研人員克服了生物樣本內(nèi)異質(zhì)性等重大挑戰(zhàn)，然而先前的單細(xì)胞測(cè)序優(yōu)勢(shì)主要集中在高通量獲取單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息，對(duì)于高通量的捕獲基因組以及多組學(xué)信息較為欠缺。 Mission Bio Tapestri平臺(tái)可以在單細(xì)胞水平，高通量的檢測(cè)來(lái)自同一細(xì)胞的SNV、 CNV以及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)，提供單細(xì)胞多組學(xué)解決方案，這將進(jìn)一步提高對(duì)細(xì)胞間異質(zhì)性的理解，提供細(xì)胞和遺傳組成的獨(dú)特見解。
單細(xì)胞基因組測(cè)序和傳統(tǒng)測(cè)序的區(qū)別
技術(shù)原理
Tapestri平臺(tái)采用“分子標(biāo)簽”技術(shù)，基于微流控的工作原理，通過兩步油包水得以實(shí)現(xiàn)。具體流程如下：用帶有oligo標(biāo)簽的抗體對(duì)制備好的單細(xì)胞懸浮液進(jìn)行孵育，細(xì)胞表面待檢測(cè)的蛋白與抗體發(fā)生結(jié)合，然后單細(xì)胞懸液進(jìn)入Tapestri平臺(tái)，通過油包水，每個(gè)油滴包裹一個(gè)細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的分離，在油滴內(nèi)完成蛋白的釋放和細(xì)胞的裂解。然后進(jìn)行第二步油包水，此次油包水主要是在油滴內(nèi)完成對(duì)蛋白o(hù)ligo和細(xì)胞內(nèi)靶向基因的標(biāo)記，使得來(lái)自同一細(xì)胞內(nèi)的基因和蛋白均帶有相同的標(biāo)記信息。接下來(lái)油滴裂解，對(duì)帶有標(biāo)記的基因和蛋白的oligo進(jìn)行測(cè)序，從而獲取單個(gè)細(xì)胞內(nèi)基因組和蛋白質(zhì)組的信息。
抗體-寡核苷酸偶聯(lián)物用于標(biāo)記每個(gè)細(xì)胞表面
微流控技術(shù)獲取單細(xì)胞DNA&蛋白質(zhì)文庫(kù)信息
單細(xì)胞DNA+蛋白質(zhì)組學(xué)工作流程
Mission Bio 單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序（SNV+CNV+蛋白）
結(jié)果展示
細(xì)胞分群圖（左）； 聚類熱圖（中）； 小提琴圖（右）
相關(guān)性分析（左）； 突變共發(fā)生魚形圖（中）； 克隆進(jìn)化分析（右）
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
超高通量
可對(duì)每個(gè)樣本的5,000-10,000個(gè)細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)分析；
平臺(tái)唯一
目前唯一的高通量單細(xì)胞DNA（SNV、 InDel、 CNV、 LOH和易位）檢測(cè)平臺(tái)，唯一的高通量單細(xì)胞DNA和蛋
白質(zhì)聯(lián)合檢測(cè)平臺(tái)；
高靈敏度
能檢測(cè)到0.1%亞克隆，即可檢測(cè)到0.1%細(xì)胞群體中發(fā)生的突變；
流程簡(jiǎn)單
工作流程簡(jiǎn)單，深度的數(shù)據(jù)分析及可視化，一鍵構(gòu)建細(xì)胞水平上突變圖譜、探索克隆分布和克隆進(jìn)化等，
實(shí)現(xiàn)DNA和蛋白分析結(jié)果的共呈現(xiàn)。
定制服務(wù)
可選擇已有的目錄化Panel，也可根據(jù)研究需求進(jìn)行靶向DNA&蛋白質(zhì)panel定制；
高性價(jià)比
與低通量或傳統(tǒng)人工操作等方法相比，成本降低數(shù)十倍；
經(jīng)驗(yàn)豐富
百奧醫(yī)藥技術(shù)團(tuán)隊(duì)現(xiàn)已累積100余種不同組織類型、數(shù)千余個(gè)樣品的單細(xì)胞測(cè)序經(jīng)驗(yàn)。
送樣要求
應(yīng)用方向
應(yīng)用案例
單細(xì)胞突變分析揭示髓系惡性血液病的克隆進(jìn)化
Single-cell mutation analysis of clonal evolution in myeloid malignancies
發(fā)表雜志：Nature （IF: 49.962）； 發(fā)表時(shí)間： 2020年 11月； 應(yīng)用技術(shù)： Mission Bio 單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序（SNV+CNV+蛋白）
骨髓惡性腫瘤，包括急性骨髓性白血?。ˋML） 在內(nèi)，是由造血干細(xì)胞和獲得體細(xì)胞突變的祖細(xì)胞擴(kuò)展造成的。盡管bulk測(cè)序可以提供有關(guān)白血病生物學(xué)和預(yù)后的信息，但是它無(wú)法區(qū)分同一克隆中發(fā)生了哪些突變，也無(wú)法準(zhǔn)確測(cè)量克隆的復(fù)雜性或確定突變的順序。本研究通過123個(gè)患者的146個(gè)樣本的單細(xì)胞突變分析，揭示了骨髓惡性腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的克隆結(jié)構(gòu)和進(jìn)化。研究發(fā)現(xiàn)AML由少數(shù)克隆控制，在表觀遺傳調(diào)控因子中經(jīng)常發(fā)生共突變。然而，信號(hào)基因的突變通常頻繁發(fā)生在不同的亞克隆中，這與克隆多樣性的增加是一致的。本研究描繪了每個(gè)樣本的克隆軌跡和發(fā)現(xiàn)了協(xié)同促進(jìn)克隆擴(kuò)展和控制的突變組合，并將蛋白質(zhì)表達(dá)與突變分析相結(jié)合，揭示了體細(xì)胞基因型和具有免疫表型的克隆結(jié)構(gòu)。為了解髓樣轉(zhuǎn)化的發(fā)病機(jī)理以及克隆復(fù)雜性如何隨疾病進(jìn)展而發(fā)展提供了視角。
髓系惡性腫瘤患者的單細(xì)胞DNA測(cè)序結(jié)果
AML代表性的遺傳軌跡（左）； 蛋白表達(dá)與基因突變關(guān)聯(lián)（右）
