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Mission Bio單細(xì)胞基因組測序（SNV+CNV）
背景介紹
單細(xì)胞測序技術(shù)的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究，幫助科研人員克服了生物樣本內(nèi)異質(zhì)性等重大挑戰(zhàn)，然而先前的單細(xì)胞測序優(yōu)勢主要集中在高通量獲取單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息，對于高通量的捕獲基因組以及多組學(xué)信息較為欠缺。 Mission Bio Tapestri平臺可以在單細(xì)胞水平，高通量的檢測來自同一細(xì)胞的SNV、 CNV以及蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)，提供單細(xì)胞多組學(xué)解決方案，這將進(jìn)一步提高對細(xì)胞間異質(zhì)性的理解，提供細(xì)胞和遺傳組成的獨特見解。
單細(xì)胞基因組測序和傳統(tǒng)測序的區(qū)別
技術(shù)原理
Mission Bio的Tapestri平臺基于微液滴的微流控裝置，利用油包水體系對細(xì)胞進(jìn)行捕獲與封裝。封裝時，細(xì)胞和蛋白酶等會被一起裝入微液滴中，每一個微液滴相當(dāng)于一個微容器。之后，細(xì)胞在微液滴中進(jìn)行裂解、加條形碼（barcoding）等步驟，再結(jié)合靶向 PCR 擴(kuò)增技術(shù)，對特定的DNA 目標(biāo)序列與蛋白產(chǎn)物進(jìn)行單細(xì)胞水平的建庫。建庫完成后，即可進(jìn)行高通量測序和后續(xù)的生物信息學(xué)分析。
Mission Bio DNA單細(xì)胞平臺原理
Mission Bio 單細(xì)胞基因組測序（SNV+CNV）
結(jié)果展示
細(xì)胞分群圖（左）； 聚類熱圖（中）； 小提琴圖（右）
相關(guān)性分析（左）； 突變共發(fā)生魚形圖（中）； 克隆進(jìn)化分析（右）
產(chǎn)品優(yōu)勢
超高通量
可對每個樣本的5,000-10,000個細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)分析；
平臺唯一
目前唯一的高通量單細(xì)胞DNA（SNV、 InDel、 CNV、 LOH和易位）檢測平臺，唯一的高通量單細(xì)胞DNA和蛋
白質(zhì)聯(lián)合檢測平臺；
高靈敏度
能檢測到0.1%亞克隆，即可檢測到0.1%細(xì)胞群體中發(fā)生的突變；
流程簡單
工作流程簡單，深度的數(shù)據(jù)分析及可視化，一鍵構(gòu)建細(xì)胞水平上突變圖譜、探索克隆分布和克隆進(jìn)化等，
實現(xiàn)DNA和蛋白分析結(jié)果的共呈現(xiàn)。
定制服務(wù)
可選擇已有的目錄化Panel，也可根據(jù)研究需求進(jìn)行靶向DNA&蛋白質(zhì)panel定制；
高性價比
與低通量或傳統(tǒng)人工操作等方法相比，成本降低數(shù)十倍；
經(jīng)驗豐富
百奧醫(yī)藥技術(shù)團(tuán)隊現(xiàn)已累積100余種不同組織類型、數(shù)千余個樣品的單細(xì)胞測序經(jīng)驗。
送樣要求
應(yīng)用方向
應(yīng)用案例
單細(xì)胞DNA測序揭示海綿狀血管畸形致病機制
PIK3CA and CCM mutations fuel cavernomas through a cancer-like mechanism
發(fā)表雜志：Nature （IF: 49.962）； 發(fā)表時間： 2021年 6月； 應(yīng)用技術(shù)： Mission Bio 單細(xì)胞多組學(xué)測序
血管畸形如腦部海綿狀血管畸形（CCMs） 是年輕人中風(fēng)和癱瘓的重要病因。對小鼠模型的研究結(jié)果顯示，同時存在KRIT1基因功能缺失和PIK3CA基因獲得性突變的小鼠發(fā)展出嚴(yán)重的CCM病變。通過對79個手術(shù)切除的CCM病變樣本的66個基因（包括CCM相關(guān)基因和PIK3CA）的bulk測序，發(fā)現(xiàn)人類CCM病變組織中也含有PIK3CA突變，并存在多個不同的突變位點。為了確定PIK3CA和CCM相關(guān)基因的體細(xì)胞突變是否出現(xiàn)在人類CCM的同一細(xì)胞中，本研究使用3個散發(fā)性和兩個家族性CCM進(jìn)行了單細(xì)胞核DNA測序。結(jié)果表明，大多數(shù)突變細(xì)胞核包含所有已鑒定的CCM相關(guān)基因和PIK3CA體細(xì)胞突變，較少的細(xì)胞核顯示了每種可能的基因型組合。這說明， PIK3CA和CCM相關(guān)基因的體細(xì)胞突變發(fā)生在同一細(xì)胞中。此外，為進(jìn)一步探究CCM的機制，本研究還利用小鼠模型對CCM中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)進(jìn)行了研究。
GOF PIK3CA突變和LOF CCM突變在人類CCM的同一細(xì)胞中共存
