發(fā)布日期：2023-03-17 11:22:06
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高通量測序(NGS)技術(shù)因通量高、速度快等優(yōu)勢在基因檢測中的應(yīng)用越來越廣泛，在基礎(chǔ)研究和臨床輔助診斷方面發(fā)揮了巨大作用，NGS實驗流程包括核酸提取、文庫構(gòu)建、上機測序、數(shù)據(jù)分析等步驟，其中文庫構(gòu)建是非常關(guān)鍵的一環(huán)，對整個實驗結(jié)果影響最大。
為滿足市場需求，百奧醫(yī)藥在積累大量二代測序相關(guān)實驗經(jīng)驗基礎(chǔ)上，自主研發(fā)了二代測序mRNA和DNA建庫系列試劑盒，可廣泛應(yīng)用于二代測序等相關(guān)科學(xué)研究實驗。
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒
一、產(chǎn)品介紹
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒（Cat.BA3105）是針對高通量測序平臺專門研發(fā)的用于mRNA轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建試劑盒。本試劑盒適用于起始量在10ng-1ug之間完整度良好的動植物和真菌等真核生物的Total RNA 。Total RNA樣品經(jīng)過mRNA分離、mRNA片段化、cDNA合成、末端修復(fù)和加A、接頭連接、連接產(chǎn)物純化和片段大小分選、文庫擴增等步驟，最終得到適用于Illumina平臺的測序文庫。本試劑盒利用磁珠分選的方式，可以快速獲得特定長度的文庫，能夠滿足不同實驗的個性化需求。
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產(chǎn)品貨號 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品規(guī)格 |
儲藏條件 |
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BA3305 |
百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒（Module II） |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、應(yīng)用領(lǐng)域
基因表達分析；單核苷酸變異分析；剪切變異體分析；基因融合鑒定。
三、測試效果
文庫產(chǎn)出：從動物（293T細(xì)胞）、植物（擬南芥）、真菌（酵母）中提取Total RNA后，分別以1ug、100ng、10ng的起始量，使用百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒（Cat:BA3105）和目前廣泛應(yīng)用的N*公司進口mRNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。由結(jié)果看出，相同循環(huán)數(shù)下使用百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒的文庫產(chǎn)出好于對標(biāo)品，尤其在低起始量下優(yōu)勢更大。
數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量：以1μg的293T細(xì)胞Total RNA起始，分別以百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒（Cat:BA3105），N*公司的mRNA試劑盒，以及國內(nèi)V*公司的mRNA試劑盒構(gòu)建文庫，質(zhì)控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測序。從下機數(shù)據(jù)分析結(jié)果看，與同類試劑盒產(chǎn)品對標(biāo)，百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒整體表現(xiàn)出色，尤其在比對率和基因檢出數(shù)上優(yōu)勢更大。
表1 百奧醫(yī)藥、N*公司以及V*公司mRNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫測序數(shù)據(jù)對比
基因表達一致性：整理百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒（Cat:BA3105），N*公司的mRNA試劑盒，以及V*公司的mRNA試劑盒構(gòu)建的文庫基因表達數(shù)據(jù)，然后進行相關(guān)性分析，從結(jié)果看出，百奧醫(yī)藥mRNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫產(chǎn)出的基因表達數(shù)據(jù)與市面上同類產(chǎn)品重復(fù)極好。
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒
一、產(chǎn)品介紹
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒（Cat.BA3106）是針對Illumina高通量測序平臺定向研發(fā)的建庫試劑盒。本產(chǎn)品適用100 pg - 1μg 起始DNA，包含常規(guī)動植物基因組、微生物基因組、FFPE、cfDNA、ChIP DNA 等樣本。試劑盒中的每種試劑都經(jīng)過了嚴(yán)格的質(zhì)量控制，且每一批次的建庫 Kit 都經(jīng)過了建庫和上機測序的驗證，保證每一批次的試劑盒性能質(zhì)量穩(wěn)定。
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產(chǎn)品貨號 |
產(chǎn)品名稱 |
產(chǎn)品規(guī)格 |
儲藏條件 |
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BA3106 |
百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒 |
24rxns |
-20℃避光保存 |
二、 應(yīng)用領(lǐng)域
全基因組測序；全外顯子或靶向捕獲測序；擴增子測序；免疫共沉淀測序；宏基因組測序
三 、測試效果
文庫產(chǎn)出：以239 T細(xì)胞片段化DNA為樣本進行建庫，DNA起始量分別為100 pg、1 ng、100 ng和1 μg，分別以百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒（Cat:BA3106）和N*公司DNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。由結(jié)果可知，對于不同起始量DNA，百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒在相同擴增循環(huán)數(shù)下文庫產(chǎn)出均高于對標(biāo)品。
數(shù)據(jù)覆蓋度：分別以起始量1ug的DNA標(biāo)準(zhǔn)品NA12878和GW-OGTM800為樣本進行建庫，分別使用百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒（Cat:BA3106）和N*公司DNA建庫試劑盒構(gòu)建文庫。質(zhì)控后的文庫用Illumina NovaSeq 6000測序，對測序數(shù)據(jù)量進行均一化，分析結(jié)果顯示，百奧醫(yī)藥DNA建庫試劑盒構(gòu)建的文庫去重后的測序深度更高。
